펩타이드 및 천연 리간드를 기반한 신규 선도물질의 탐색 Case study | 6 min read 성공적인 가상 스크리닝 계획 및 실시의 열쇠는 구매할 화합물을 효과적으로 결정하기 위해 검토 중인 타 겟에 대한 이용 가능한 모든 정보를 활용하고 가능한 한 다양한 chemical space를 탐색하는 것입니다. 본 ...
RIPK1阻害薬の構造活性相関分析 Case study | 4 min read またこのSAR分析に、Flareのタンパク質相互作用ポテンシャル (PIP) およびElectrostatic Complementarity™ (EC) 静電的相補性マップを組み合わせることにより、リガンド設計においていかに有益な情報が得られるかを示します。
Investigating the SAR of RIPK1 inhibitors Case study | 14 min read This study shows how the SAR analysis tools in Forge can work in synergy with the Protein Interaction potentials (PIPs) and Electrostatic Complementarity™ (EC) maps in Flare to provide useful ...
基于结构与配体的方法协同研究RIPK1抑制剂的SAR Case study | 3 min read 摘要:从探索化学空间到先导化合物优化,理解结构-活性关系(SAR)是药物发现诸多方面的基础工作。在本算例中,使用Forge的Activity Miner和Activity Atlas两个模块分析一系列苯并噁嗪酮类RIPK1抑制剂的SAR,演示了如何将Forge的SAR分析工具与Flare的蛋白质相互作用势及静电互补性分析协同工作,为配体设计提供了有用的见解。
Streamlining design for covalent inhibitors Case study | 10 min read The discovery of the covalent inhibitor of Bruton’s Tyrosine Kinase (BTK) Evobrutinib was used as a basis to demonstrate how the covalent docking workflow within Flare™ can aid design and ...
공유 결합 억제제의 효율적인 설계 Case study | 8 min read 본 사례에서는 Bruton’s Tyrosine Kinase(BTK) 억제제 Evobrutinib 의 발견을 예로 들어 Flare 의 공유 결합 도킹 워크플로가 공유 결합 화합물의 효율적인 설계 및 우선 순위 매김에 어떻게 활용될 수 있는지 ...
Pick new ligand-protein interactions from the active site with Spark™ Case study | 8 min read In this case study we will use the new Spark docking feature of the Cresset bioisostere replacement and scaffold hopping tool to prioritize alternative R-groups picking ligand protein interactions directly ...
Spark™を利用して活性部位から新規のリガンド-蛋白質相互作用を見つける Case study | 2 min read Spark はCresset社の生物学的等価体(Bioisostere)置換およびスキャフォールドホッピングツールですが、新たにドッキング機能が搭載されました。本事例紹介では、GSK-3βの活性部位の構造をもとに、Sparkを利用してリガンド-蛋白質相互作用を作ることのできる代替置換基を直接見つけ、それら置換基をランクづけすることを解説します。
Spark™을 이용한 활성 자리에서 새로운 ligand-protein간 상호작용의 발견 Case study | 6 min read 본 사례에서는 Cresset사의 bioisostere 치환 및 scaffold hopping 도구인 Spark의 새로운 docking 기능을 이용하여 GSK-3β의 활성 자리에서 직접적으로 ligand-protein간 상호작용을 할 수 있는 대체 R-group을 발견하고 이들을 서열화 하는 것에 ...
从活性位点里发现新的蛋白-配体相互作用 Case study | 2 min read 在本算例中,我们使用Cresset生物等排体替换与骨架跃迁工具SPARK的对接功能,直接从GSK-3β活性位点挑选配体蛋白相互作用可供选择的R-基团替换,并进行优先排序。
Data-driven estimation of optimally-designed perturbation networks in relative alchemical free energy calculations Poster pdf