BTK共价抑制剂的设计 Case study | 3 min read 摘要:已上市的或正在研发中的共价化合物数量表明药物化学重新引起了人们对靶向共价抑制剂的兴趣。 本文以Bruton酪氨酸激酶(BTK)共价抑制剂Evobrutinib[1]的发现为例,演示如何用Flare[2]中的共价对接工作流来帮助进行共价化合物的设计及其优先排序。
ペプチド・天然リガンドに基づく新規リード探索 Case study | 2 min read バーチャルスクリーニングの計画と実施の鍵は、検討中のターゲットのできるだけ多くの情報を活用し、可能な限り広くケミカルスペースを探索し、その結果、購入する化合物を効果的に決定することです。ここでは、FOXOペプチドの代替となる可能性のある低分子化合物を見つける研究事例を取り上げます。そのために、Blaze™によるリガンドベースのバーチャルスクリーニングとFlare™によるタンパク質構造情報を合わせて活用します。
Finding new leads from peptides and natural ligands Case study | 9 min read In this study, we used a combination of ligand-based virtual screening with Blaze™ and information about the protein structure from Flare™ to find ligands that could be potentially used as ...
从肽类与天然产物里发现先导化合物 Case study | 2 min read 设计、执行一个成功虚拟筛选的关键是利用所有关于靶标的可用信息,在选择、采购化合物时尽可能多地探索不同的化学空间。在本研究中,我们联合使用了基于配体的虚拟筛选方法Blaze与以及从Flare得到的关于蛋白结构的信息以寻找可能合适作为FOXO-肽模拟物的配体。
펩타이드 및 천연 리간드를 기반한 신규 선도물질의 탐색 Case study | 6 min read 성공적인 가상 스크리닝 계획 및 실시의 열쇠는 구매할 화합물을 효과적으로 결정하기 위해 검토 중인 타 겟에 대한 이용 가능한 모든 정보를 활용하고 가능한 한 다양한 chemical space를 탐색하는 것입니다. 본 ...
RIPK1阻害薬の構造活性相関分析 Case study | 4 min read またこのSAR分析に、Flareのタンパク質相互作用ポテンシャル (PIP) およびElectrostatic Complementarity™ (EC) 静電的相補性マップを組み合わせることにより、リガンド設計においていかに有益な情報が得られるかを示します。
Investigating the SAR of RIPK1 inhibitors Case study | 14 min read This study shows how the SAR analysis tools in Forge can work in synergy with the Protein Interaction potentials (PIPs) and Electrostatic Complementarity™ (EC) maps in Flare to provide useful ...
基于结构与配体的方法协同研究RIPK1抑制剂的SAR Case study | 3 min read 摘要:从探索化学空间到先导化合物优化,理解结构-活性关系(SAR)是药物发现诸多方面的基础工作。在本算例中,使用Forge的Activity Miner和Activity Atlas两个模块分析一系列苯并噁嗪酮类RIPK1抑制剂的SAR,演示了如何将Forge的SAR分析工具与Flare的蛋白质相互作用势及静电互补性分析协同工作,为配体设计提供了有用的见解。
Streamlining design for covalent inhibitors Case study | 10 min read The discovery of the covalent inhibitor of Bruton’s Tyrosine Kinase (BTK) Evobrutinib was used as a basis to demonstrate how the covalent docking workflow within Flare™ can aid design and ...
공유 결합 억제제의 효율적인 설계 Case study | 8 min read 본 사례에서는 Bruton’s Tyrosine Kinase(BTK) 억제제 Evobrutinib 의 발견을 예로 들어 Flare 의 공유 결합 도킹 워크플로가 공유 결합 화합물의 효율적인 설계 및 우선 순위 매김에 어떻게 활용될 수 있는지 ...
Pick new ligand-protein interactions from the active site with Spark™ Case study | 8 min read In this case study we will use the new Spark docking feature of the Cresset bioisostere replacement and scaffold hopping tool to prioritize alternative R-groups picking ligand protein interactions directly ...
Spark™を利用して活性部位から新規のリガンド-蛋白質相互作用を見つける Case study | 2 min read Spark はCresset社の生物学的等価体(Bioisostere)置換およびスキャフォールドホッピングツールですが、新たにドッキング機能が搭載されました。本事例紹介では、GSK-3βの活性部位の構造をもとに、Sparkを利用してリガンド-蛋白質相互作用を作ることのできる代替置換基を直接見つけ、それら置換基をランクづけすることを解説します。