JAK阻害薬の3D-QSAR
Case study
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Forge™ は構造活性相関解析および分子デザインのためのCresset社のリガンドベース中心の創薬支援ソフトウエアです1。Forgeは、Cressetの3D-QSARの実装であるField QSARまたは他の機械学習手法によって、信頼性・予測性の高い定量的構造活性相関(QSAR)モデルを構築します。共通の結合モードをもち適度な結合力または活性値の分布があれば、どのようなデータセットに対しても一定のモデルを構築することができます。この事例紹介では、Janusキナーゼ JAK1およびJAK2阻害活性をもつ196個の分子からなるデータセットを使用し、Forgeによる活性予測機械学習およびField QSARモデルを構築します。QSARモデル情報ツールを使用して予測性能を最大化するモデルを選択し、3D表示でモデルを視覚化してその解釈を支援します。